Partitura de "Cantilena do cego e do ladrão", incluída na música do filme "O Rio do Ouro" (1998), de Paulo Rocha. José Mário Branco foi responsável pela música deste filme.

Partitura de "Cantigas", também identificada em várias maquetes como "Cantiga do ódio", com música de José Mário Branco a partir de três poemas de Carlos de Oliveira: “O Viandante”, “Cantiga dos cravos” e “Cantiga do ódio”.

Partitura de canção "Saudade", com música e arranjo para voz de Riccardo Fancini e letra de Edson Macedo dos Santos. Esta partitura foi oferecida a José Mário Branco por ocasião de actuações realizadas em Itália.

Partitura de canção com o título "Je pars mon amie", presumivelmente da autoria de José Mário Branco.

Partitura para voz, guitarra e violoncelo de "Canção do sol e da lua" (com indicação de título "Olha que o sol vem" e dedicatória "Canção de embalar para a Joana"), música da autoria de José Peixoto, letra de Nuno Artur Silva e Sílvia Cunha. Com arranjos de José Mário Branco, foi incluída no disco "Bom dia, Benjamim" (1995), no qual José Mário Branco foi responsável pelos arranjos e direcção musical.

Partitura de "Canção do sol e da lua", música da autoria de José Peixoto, letra de Nuno Artur Silva e Sílvia Cunha. Com arranjos de José Mário Branco, foi incluída no disco "Bom dia, Benjamim" (1995), no qual José Mário Branco foi responsável pelos arranjos e direcção musical.

Partitura de vozes para ocarina e flautas de "Canção do sol e da lua", música da autoria de José Peixoto, letra de Nuno Artur Silva e Sílvia Cunha. Com arranjos de José Mário Branco, foi incluída no disco "Bom dia, Benjamim" (1995), no qual José Mário Branco foi responsável pelos arranjos e direcção musical.

Partitura de "Campanhã", incluída nos espectáculos "Sons do Porto - A cidade a oito vozes" apresentados pelo Canto Nono no âmbito da programação do Porto 2001 - Capital Europeia da Cultura, e também no disco "O Porto a Oito Vozes", publicado em 2003. Inclui indicação de "Três menos eu", presumivelmente do indicativo originalmente incluído no filme "Três Menos Eu" (1988), de João Canijo, no qual José Mário Branco foi responsável pela música. José Mário Branco fez o arranjo desta música para o grupo Canto Nono. Esta partitura foi presumivelmente utilizada na música da peça de teatro "1974", encenada por Miguel Seabra e apresentada pelo Teatro Meridional em 2010. José Mário Branco foi responsável pela música desta peça.

Partitura para voz e piano de "Cá vou eu prá escola", música de João Paulo Estesves da Silva, letra de Luís Miguel Viterbo. Com arranjos de José Salgueiro e José Mário Branco, foi incluída no disco "Bom dia, Benjamim" (1995), no qual José Mário Branco foi responsável pelos arranjos e direcção musical.

Partitura de "Balade", sobre texto de Charles d'Orleans. Esta canção foi incluída no filme "A Portuguesa" (2018), de Rita Azevedo Gomes, a partir da novela "Die Portugiesin" do escritor austríaco Robert Musil, com adaptação cinematográfica da escritora Agustina Bessa-Luís. José Mário Branco foi responsável pela música deste filme. Inclui os seguintes instrumentos: voz, oboé e guitarra.